提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
两岸民众往来受限 国台办：敦促民进党当局撤除不合理障碍******
中新社北京1月11日电 (记者 王捷先 张晓曦)国务院台办11日在北京举行例行新闻发布会，发言人马晓光敦促民进党当局顺应民意，撤除三年来设置的种种不合理障碍，推动“小三通”全面复航早日实现，尽快恢复两岸原有客运航点，恢复两岸人员往来正常化和两岸民众交流常态化。
1月11日，国务院台办在北京举行例行新闻发布会，发言人马晓光敦促民进党当局顺应民意，撤除三年来设置的种种不合理障碍，推动“小三通”全面复航早日实现，尽快恢复两岸原有客运航点，恢复两岸人员往来正常化和两岸民众交流常态化。 中新社记者 张宇 摄1月7日，暂停了近三年的两岸“小三通”海上客运航线部分复航。但马晓光指出，这与广大台胞期盼还有很大差距。不仅广大台商、台生、台干被排除在外，大陆民众也由于民进党当局限制，无法循此渠道赴台。远远不能满足两岸同胞的期待。
他介绍，时值春节临近，为便利台湾同胞返乡过年，大陆有关方面积极支持两岸航空业者大幅增加两岸航线航班。相关航空公司会陆续增加运力，调整两岸运输安排，两岸航班会明显增加。大陆原有61个两岸空中客运航点，疫情以来，民进党当局单方面关闭了大多数，目前仅有4个大陆航点。期盼通过扩大航点增加运力，为台湾同胞返乡过年提供保障。
关于台陆委会副主委邱垂正称大陆目前只核准大陆4个航点开通29个两岸航班班次，马晓光表示，大陆现在疫情防控平稳有序转段，两岸完全有更好的条件尽快开通更多航点，满足两岸人员往来需要。“据我了解，大陆方面一直希望增加航点，并已向台湾方面提出。”
他指出，运力和客源是互为因果关系的问题。过去受疫情影响，两岸同胞不能正常往来，客流量肯定会下降，航空公司自然会减少航班。现在我们希望这个问题能变成良性循环，增加航班是一方面，尽快开放两岸人员正常交流往来是更重要的方面。随着两岸同胞往来恢复正常，更趋频密和方便，两岸航点、运力和客源也会随之增多。
有记者问及台当局防疫部门负责人曾表示就疫情向大陆表达了互助合作意愿，马晓光首先指出，疫情发生以来，岛内一些政客利用疫情进行政治操弄，或“以疫谋独”、或对大陆进行攻击污蔑，或煽动“反中抗中”。这些劣迹都将被记在两岸关系历史上。至于台湾防疫部门负责人的有关说法，他说，两岸医药卫生合作协议大陆窗口单位没有收到相关信息。
有关民进党当局要求从大陆经港澳赴台人员提交核酸证明，马晓光指出，民进党当局唯独针对大陆赴台旅客进行核酸检测，显然与科学防疫无关。
回应开放大陆学生赴台就读问题时，马晓光表示，我们推动两岸同胞恢复正常交流往来，政策信号是清晰的，态度是坚定的。大陆学生赴台就读学位生，是两岸关系和平发展的产物。
他说，民进党上台以来，几乎将两岸关系和平发展成果破坏殆尽。“台独”浊浪弥漫台湾校园，使大陆家长和学生望而却步。岛内没有陆生，责任在谁，一目了然。道理很清楚，在“九二共识”基础上推动两岸关系改善与发展，就能不断增进两岸同胞的利益和福祉。(完)
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